{"id":1479,"date":"2018-07-06T10:18:26","date_gmt":"2018-07-06T08:18:26","guid":{"rendered":"http:\/\/biodiv.iptpo.hr\/?page_id=1479"},"modified":"2018-07-06T10:47:09","modified_gmt":"2018-07-06T08:47:09","slug":"ep-7-grah","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/biodiv.iptpo.hr\/?page_id=1479&lang=hr","title":{"rendered":"GRAH"},"content":{"rendered":"

Voditelj elementa: doc.dr.sc. Klaudija Carovi\u0107-Stanko<\/strong><\/p>\n

Suradnici na elementu: prof.dr.sc. Jerko Gunja\u010da, doc.dr.sc. Boris Lazarevi\u0107<\/strong><\/p>\n<\/div>

Aktivnost 1: O\u010duvanje biljnih genetskih izvora graha<\/strong><\/p>\n

OPIS AKTIVNOSTI<\/p>\n

(1) Tvorba osnovne kolekcije tradicijskih kultivara graha: prikupiti \u0107e se primke tradicijskih kultivara graha s podru\u010dja Hrvatske, susjednih zemalja (Srbije, Bosne i Hercegovine, Makedonije) te zemalja Europske unije u kojima grah predstavlja zna\u010dajnu poljoprivrednu kulturu (Slovenija, Portugal, Italija, \u0160panjolska, Austrija) i te \u0107e primke \u010diniti osnovnu kolekciju.<\/p>\n

(2) Poljski pokus: prikupljeno sjeme biti \u0107e umno\u017eeno i regenerirano uzgojem biljaka u poljskom pokusu tijekom kojeg \u0107e primke biti morfolo\u0161ki opisane prema listi deskriptora s ciljem formiranja radne kolekcije, koja \u0107e predstavljati niske morfotipove. Boja sjemene ljuske primki iz radne kolekcije biti \u0107e analizirana snimanjem pomo\u0107u fenotipizacijske platforme opremljene VIS, IR, NIR senzorima.<\/p>\n

(3) Priprema uzoraka: Tijekom poljskog pokusa uzorkovati \u0107e se uzorci biljnog materijala za ekstrakciju DNA koja \u0107e slu\u017eiti daljnje genetske analize te uzorci sjemena za analizu mineralnog sastava.<\/p>\n

(4) Odre\u0111ivanje podrijetla: u svrhu odre\u0111ivanja podrijetla primki odrediti \u0107e se fazeolin tip.<\/p>\n

Povezanost s ciljem: Aktivnost je povezana s ciljem 1 u dijelu koji se odnosi na uspostavu kolekcije biljnih genetskih izvora u svrhu opisa i procjene morfolo\u0161kih svojstava graha, odre\u0111ivanja podrijetla primki, te o\u010duvanje biljnih genetskih izvora.<\/p>\n

Aktivnost 2: Fenotipizacija graha<\/strong><\/p>\n

OPIS AKTIVNOSTI<\/p>\n

(1) Odre\u0111ivanje nutritivne vrijednosti primki tradicijskih kultivara graha: sjeme primki iz radne kolekcije biti \u0107e pobrano u tehnolo\u0161koj zriobi, odrediti \u0107e mu se svje\u017ea masa, a nakon su\u0161enja u su\u0161ioniku i suha masa. Nakon mljevenja i homogenizacije uzoraka odrediti \u0107e se mineralni sastav (koncentracije N, P, K, Ca, Mg, Fe, Zn, Mn i Cu) u suhoj tvari. Analiza du\u0161ika provest \u0107e se po metodi po Kjeldahlu, dok \u0107e se koncentracije ostalih hranjiva odrediti pomo\u0107u ICP (Inductively Coupled Plasma Analysis).<\/p>\n

(2) Fenotipska varijabilnost korijenovog sustava primki: kori\u0161tenjem najnovijih dostupnih metoda upotrebom uzgoja klijanaca u pouch sustavima na hranjivim otopinama, stvaranjem digitalnih fotografija korijena uz pomo\u0107 fenotipizacijske platforme opremljene VIS, IR, NIR senzorima te njihovom automatiziranom ra\u010dunalnom obradom i analizom, na inovativan na\u010din \u0107e se analizirati fenotipske karakteristike korijenovog sustava. U pokusu \u0107e se koristiti hranjive otopine u \u010dijoj \u0107e se izradi koristit GeoChem EZ softver \u0161to predstavlja najmoderniji pristup modeliranju aktivnosti biljnih hranjiva u otopini. Digitalno fotografiranje korijena i ra\u010dunalna analiza kori\u0161tenjem specijaliziranog WinRhizo (Regent Instruments, Inc) softvera omogu\u0107uje prikupljanje egzaktnih podataka u identi\u010dnim uvjetima za sve ispitivane genotipove. Brzina, preciznost i ponovljivost \u010dine ovu metodu vrlo zanimljivom za primjenu u proizvodnom i znanstvenom sektoru. Fenotipske karakteristike (arhitektura) biljnih organa usko su povezane s njihovom morfologijom i funkcijom. Tako \u0107e arhitektura korijenovog sustava primki graha utjecati na sposobnost usvajanja vode, fosfora i du\u0161ika te njihov transport unutar korijena. Na temelju fenotipskih karakteristika korijenovog sustava (\u0161irine, dubine, kutova grananja, ukupne duljine, povr\u0161ine, volumena, promjera te omjera bo\u010dnog i primarnog korijenja) odabrati \u0107e se genotipovi potencijalno visokou\u010dinkoviti u usvajanju du\u0161ika i fosfora te tolerantni na su\u0161u.<\/p>\n

(3) Odre\u0111ivanje reakcija i deskriptivnih parametara fenotipskih karakteristika nadzemnih organa graha u stresnim uvjetima nedostatka du\u0161ika, fosfora i vode: nakon odabira genotipova graha s po\u017eeljnim fenotipskim karakteristikama korijenovog sustava, odabrane primke \u0107e se uzgojiti u eksperimentalnim stresnim uvjetima nedostatka du\u0161ika i fosfora te su\u0161e. Za modeliranje aktivnosti pojedinih hranjiva u hranjivim otopinama i razine osmotske aktivnosti hranjivih otopina koristit \u0107e se GeoChem EZ softver. Biljke \u0107e se uzgajati do faze cvatnje, a tijekom tog perioda pomo\u0107u fenotipizacijske platforme opremljene VIS i NIR kamerama i senzorima odre\u0111ivati \u0107e se fenotipske karakteristike nadzemnih organa (lisna povr\u0161ina, visina biljaka, biomasa, sadr\u017eaj klorofila, temperatura, konduktivnost pu\u010di, intenzitet rasta i dr.). Za odre\u0111ivanje razine stresa izazvanog nedostatkom du\u0161ika, fosfora i vode mjerit \u0107e se kvantna efikasnost PSII pomo\u0107u Plant stress kita (Opti-sciences) kod na tamu i na svjetlo adaptiranih biljaka. Na kraju pokusa odrediti \u0107e se svje\u017ea i suha masa nadzemnih organa i korijena biljaka, te \u0107e se analizirati koncentracije du\u0161ika i fosfora u nadzemnim biljnim organima.<\/p>\n

Povezanost s ciljem: Aktivnost je povezana s ciljem 1 u dijelu koji se odnosi na provedbu fenotipizacije kolekcije u svrhu: odre\u0111ivanja deskriptivnih parametara povezanih s pove\u0107anom nutritivnom vrijednosti graha; odre\u0111ivanja deskriptivnih parametara fenotipskih svojstava korijenovog sustava primki iz radne kolekcije graha i odabira genotipova s po\u017eeljnim fenotipskim svojstvima korijenovog sustava koji predstavljaju potencijalno visokou\u010dinkovite genotipove u usvajanju du\u0161ika i fosfora, te genotipove tolerantne na su\u0161u, te odre\u0111ivanja reakcija i deskriptivnih parametara fenotipskih svojstava nadzemnih organa graha u stresnim uvjetima nedostatka du\u0161ika, fosfora i vode<\/p>\n

Aktivnost 3: Genotipizacija graha<\/strong><\/p>\n

\u00a0<\/strong><\/p>\n

OPIS AKTIVNOSTI<\/p>\n

(1) Analiza mikrosatelitnim biljezima: razvijeni mikrosatelitni biljezi biti \u0107e kori\u0161teni u analizi genetske strukture i raznolikosti tradicijskih kultivara graha, kao i u provedbi pridru\u017eivaju\u0107eg kartiranja u svrhu utvr\u0111ivanja biljega vezanih za gene koji kontroliraju koli\u010dinu bioaktivnih hranivih tvari te po\u017eeljnih fenotipskih karakteristika korijenovog sustava.<\/p>\n

(2) Analiza pomo\u0107u DarTSeq platforme: uz pomo\u0107 DarTSeq tehnologije sekvenciranja bit \u0107e razvijeni SNP biljezi koje je mogu\u0107e povezati sa utvr\u0111enim genima, osobito onima vezanima za koli\u010dinu minerala te odre\u0111enom, po\u017eeljnom fenotipskom karakteristikom korijenovog sustava.<\/p>\n

(3) Pridru\u017eivaju\u0107e kartiranje: u svrhu identifikacije lokusa za kvantitativna svojstva (QTL) koji su povezani sa odabranim fenotipskim indikatorskim svojstvima pove\u0107ane efikasnost kori\u0161tenja fosfora i du\u0161ika, pove\u0107ane tolerantnosti na su\u0161u te koncentracije mineralnih elemenata u sjemenu provesti \u0107e se pridru\u017eivaju\u0107e kartiranje.<\/p>\n

Povezanost s ciljem: Aktivnost je povezana s ciljem 1 u dijelu koji se odnosi na provedbu genotipizacije kolekcije u svrhu procjene genetske strukture i raznolikosti tradicijskih kultivara graha, te identifikacije lokusa za kvantitativna svojstva (QTL) za po\u017eeljna svojstva korijenovog sustava, te koli\u010dinu bioaktivnih hranivih tvari u zrnu graha.<\/p>\n<\/div>

<\/div><\/div><\/div><\/div><\/div>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"parent":1261,"menu_order":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":{"footnotes":""},"class_list":["post-1479","page","type-page","status-publish","hentry"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/biodiv.iptpo.hr\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/pages\/1479","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/biodiv.iptpo.hr\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/biodiv.iptpo.hr\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/biodiv.iptpo.hr\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/biodiv.iptpo.hr\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=1479"}],"version-history":[{"count":7,"href":"https:\/\/biodiv.iptpo.hr\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/pages\/1479\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":1488,"href":"https:\/\/biodiv.iptpo.hr\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/pages\/1479\/revisions\/1488"}],"up":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/biodiv.iptpo.hr\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/pages\/1261"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/biodiv.iptpo.hr\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=1479"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}