{"id":1539,"date":"2018-07-16T11:51:28","date_gmt":"2018-07-16T09:51:28","guid":{"rendered":"http:\/\/biodiv.iptpo.hr\/?page_id=1539"},"modified":"2018-07-16T12:10:59","modified_gmt":"2018-07-16T10:10:59","slug":"dalmatinski-buhac-i-kadulja","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/biodiv.iptpo.hr\/?page_id=1539&lang=hr","title":{"rendered":"DALMATINSKI BUHA\u010c I KADULJA"},"content":{"rendered":"

Voditelj elementa: prof. dr. sc. Zlatko Liber <\/strong><\/p>\n

Suradnici na elementu: doc. dr. sc. Martina Grdi\u0161a, doc. dr. sc. Ivan Radosavljevi\u0107 <\/strong><\/p>\n<\/div>

Aktivnost 1\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0 O\u010duvanje biljnih genetskih izvora dalmatinskog buha\u010da i kadulja<\/strong><\/p>\n

Opis aktivnosti\u00a0 (1) Prikupljanje primki i popunjavanje kolekcije dalmatinskog buha\u010da (Tanacetum cinerariifolium \/Trevir.\/ Sch. Bip.) i kadulja (Salvia officinalis L.; S. x auriculata Mill.; Salvia fruticosa Mill.; Salvia brachyodon Vandas): biljni materijal (sjeme i lisno tkivo) prirodnih populacija dalmatinskog buha\u010da i kadulja biti \u0107e prikupljeno na podru\u010dju prirodnog rasprostranjenja u RH, BiH, Crnoj Gori i Albaniji.<\/p>\n

(2) Provedba poljskog pokusa: prikupljeno sjeme dalmatinskog buha\u010da biti \u0107e umno\u017eeno i regenerirano uzgojem biljaka u poljskom pokusu.<\/p>\n

(3) Priprema uzoraka dalmatinskog buha\u010da: tijekom poljskog pokusa uzorkovat \u0107e se biljni materijal za ekstrakciju DNA na temelju koje \u0107e biti provedene daljnje genetske analize, dok \u0107e cvatne glavice biljaka dalmatinskog buha\u010da biti uzorkovane za budu\u0107e analize na biokemijskoj razini.<\/p>\n

(4) Priprema uzoraka kadulja: lisno tkivo kadulja uzorkovano na prirodnom stani\u0161tu vrsta biti \u0107e pohranjeno u vre\u0107ice sa silikagelom do provedbe genetskih analize, dok \u0107e za provedbu biokemijskih analiza biti uzorkovana svje\u017ea nadzemna masa kadulja.<\/p>\n

Povezanost s ciljem\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0 Aktivnost je povezana s ciljem 1 u dijelu koji se odnosi na uspostavu osnovne i poljske kolekcije biljnih genetskih izvora dalmatinskog buha\u010da i kadulja u svrhu osiguravanja biljnog materijala za daljnje analize na kemijskog i genetskoj razini, kao i o\u010duvanja ovih prirodnih populacija.<\/p>\n

Aktivnost 2\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0 Fenotipizacija dalmatinskog buha\u010da i kadulja<\/strong><\/p>\n

Opis aktivnosti\u00a0 (1) Utvr\u0111ivanje sadr\u017eaja i sastava piretrina u cvjetnim glavicama dalmatinskog buha\u010da: berba cvjetnih glavica dalmatinskog buha\u010da za biokemijske analize biti \u0107e provedena u fazi kada je \u00be cjevastih cvjetova otvoreno. Cvjetne glavice \u0107e biti osu\u0161ene prirodnim putem, u zatamnjenoj i prozra\u010dnoj sobi, do kona\u010dnog sadr\u017eaja vlage od 10 do 12%. Ekstrakcija piretrina iz osu\u0161enih cvjetnih glavica biti \u0107e provedena utrazvu\u010dnom ekstrakcijom koriste\u0107i aceton kao otapalo. Identifikacija i kvantifikacija aktivnih sastavnica piretrina i ukupnih piretrina teku\u0107inskom kromatografijom visoke djelotvornosti (HPLC),<\/p>\n

(2) Utvr\u0111ivanje sadr\u017eaja i sastava eteri\u010dnih ulja iz uzoraka kadulja: postupkom mikrovalne ekstrakcije biti \u0107e izolirano eteri\u010dno ulje kadulja dok \u0107e identifikacija i kvantifikacija glavnih aktivnih sastavnica biti provedena pomo\u0107u plinskog kromatografa s masenim i FID detektorom (GC-MS\/FID).<\/p>\n

Povezanost s ciljem\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0 Aktivnost je povezana s ciljem 1 u dijelu koji se odnosi na provedbu fenotipizacije kolekcije dalmatinskog buha\u010da i kadulja u svrhu utvr\u0111ivanja biokemijske raznolikosti prikupljenih prirodnih populacija.<\/p>\n

Aktivnost 3\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0 Genotipizacija dalmatinskog buha\u010da i kadulja<\/strong><\/p>\n

Opis aktivnosti\u00a0 (1) Izolacija DNA i RNA iz biljnog materijala: izolacija DNA i RNA iz uzoraka populacija dalmatinskog buha\u010da i kadulja biti \u0107e provedena pomo\u0107u izolacijskih kompleta i ure\u0111aja za automatsku izolaciju.<\/p>\n

(2) Sekvenciranje genoma i transkriptoma dalmatinskog buha\u010da i kadulja: sekvenciranje genoma i transkriptoma provest \u0107e se primjenom tehnologije sekvenciranja nove generacije (NGS sekvenciranje) s posebnim naglaskom na \u201enanopore\u201c pristupu. Prednost ovakvog pristupa je o\u010ditavanje dugih DNA\/RNA sekvenci, a to \u0107e, kombiniranjem s drugim NGS pristupima, uvelike olak\u0161ati sklapanje cjelokupnog genoma\/egzona de novo. Budu\u0107i da su kadulje primjer biljnih vrsta s malim, a buha\u010d primjer biljne vrste s izrazito velikim genomom, sekvenciranje nove generacije \u0107e biti jedinstveno testirano s obzirom na ovako ekstremne razlike u veli\u010dini genoma.<\/p>\n

(3) Razvitak novih SNPs molekularnih biljega: pomo\u0107u tehnologije sekvenciranja nove generacije (Sequencing-Based Diversity Array Technology \/DarTSeq\/) razvit \u0107e se brojni SNPs biljezi (Single Nucleotide Polymorphisms) koje \u0107e biti mogu\u0107e povezati s genima za razli\u010dite biosintetske puteve (osobito one vezane za sintezu piretrina i eteri\u010dnih ulja) detektiranim NGS sekvenciranjem genoma i transkriptoma dalmatinskog buha\u010da i kadulja.<\/p>\n

(4) Analiza SNPs biljezima: razvijeni SNPs biljezi bit \u0107e upotrebljeni za analizu genetske raznolikosti i strukture sakupljenih prirodnih populacija.<\/p>\n

(5) Pridru\u017euju\u0107e kartiranje: na temelju rezultata genetskih i biokemijskih analiza provest \u0107e se pridru\u017euju\u0107e kartiranje, u svrhu identifikacije biljega koji su povezani sa sintezom piretrina kod dalmatinskog buha\u010da i eteri\u010dnih ulja kod kadulja.<\/p>\n

Povezanost s ciljem\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0 Aktivnost je povezana s ciljem 1 u dijelu koji se odnosi na provedbu genotipizacije kolekcije u svrhu identifikacije gena kandidata koji su povezani sa sintezom piretrina i glavnim sastavnicama eteri\u010dnih ulja kadulja, procjene genetske strukture i raznolikosti prirodnih populacija dalmatinskog buha\u010da i kadulja kao i identifikacije DNA biljega koji su vezani na gene koji nadziru sintezu piretrina i glavnih sastavnica eteri\u010dnih ulja kadulja.<\/p>\n<\/div>

<\/div><\/div><\/div><\/div><\/div>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"parent":1261,"menu_order":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":{"footnotes":""},"class_list":["post-1539","page","type-page","status-publish","hentry"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/biodiv.iptpo.hr\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/pages\/1539","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/biodiv.iptpo.hr\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/biodiv.iptpo.hr\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/biodiv.iptpo.hr\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/biodiv.iptpo.hr\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=1539"}],"version-history":[{"count":3,"href":"https:\/\/biodiv.iptpo.hr\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/pages\/1539\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":1543,"href":"https:\/\/biodiv.iptpo.hr\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/pages\/1539\/revisions\/1543"}],"up":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/biodiv.iptpo.hr\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/pages\/1261"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/biodiv.iptpo.hr\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=1539"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}