{"id":244,"date":"2016-09-27T14:01:37","date_gmt":"2016-09-27T12:01:37","guid":{"rendered":"http:\/\/biodiv.iptpo.hr\/?page_id=244"},"modified":"2016-12-20T00:27:04","modified_gmt":"2016-12-19T23:27:04","slug":"genotipizacija","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/biodiv.iptpo.hr\/?page_id=244&lang=hr","title":{"rendered":"Genotipizacija"},"content":{"rendered":"

Genotipizacija<\/strong><\/h1>\n<\/div>
<\/div>
<\/div><\/div>
<\/div><\/div><\/div>
<\/div><\/div><\/div><\/div><\/div>
<\/span><\/mask><\/g><\/g><\/clipPath><\/filter><\/defs><\/svg><\/div><\/div><\/div>
<\/div><\/div><\/div>

Tehnike genotipizacije su drasti\u010dno uznapredovale posljednjeg, iako i dalje postoje razlike u razvoju postupaka genotipizacije me\u0111u pojedinim biljnim vrstama. Genotipizacija visoke propusnosti je revolucionalizirala istra\u017eivanja na podru\u010dju genetike analizom genoma visoke rezolucije pri \u010demu je do\u0161lo do promjena sustava biljega, od mikrosatelitnih (SSR) prema sustavima DArT i SNP. Mikrosatelitnih biljezi su kori\u0161teni uglavnom u procjenama raznolikosti i genetske strukture populacija kod ve\u0107eg broja biljnih vrsta. Tradicionalna metoda razvoja mikrosatelitnih biljega zahtijeva znatna financijska sredstava, no oni se i dalje koriste u ve\u0107ini laboratorija diljem svijeta. Laboratoriji za genotipizaciju u Hrvatskoj tako\u0111er koriste uglavnom mikrosatelitnine biljege kao tehni\u010dki nezahtjevni sustav biljega. Hrvatski laboratoriji nisu me\u0111usobno povezani i ne postoji kontinuirana suradnja me\u0111u njima pri \u010demu nisu poznati njihove snage, slabosti, prilike i prijetnje.<\/p>\n

Za razliku od drugih sustava biljega (uklju\u010duju\u0107i mikrosatelitne biljege), biljezi SNP su manje radno i vremenski intenzivni pri \u010demu manji tro\u0161kovi dopu\u0161taju izvo\u0111enje genotipizaciju visoke propusnosti. Biljezi SNP su dvoalelni, sadr\u017eavaju manje genetskih informacija od vi\u0161ealelnih mikrosatelitnih biljega, no pojavljuju se u puno ve\u0107oj gusto\u0107i u genomu i imaju zna\u010dajno ni\u017eu stopu pogre\u0161ke pri genotipizaciji. U posljednje vrijeme, biljezi SNP se koriste za konstrukciju \u010dipova za genotipizaciju koji sadr\u017eavaju tisu\u0107e ili nekoliko desetaka tisu\u0107a biljega raspore\u0111enih po cijelom genomu za analizu velikog broja uzoraka. \u010cipovi SNP omogu\u0107uju analizu povezanosti izme\u0111u biljega i fenotipa pedstavljaju\u0107i mo\u0107ni alat za razlu\u010divanje slo\u017eenih svojstava pomo\u0107u analize povezanosti na sveukupnom genomu (genome-wide association study; GWAS), analize lokusa za kvantitativnih svojstava (quantitatative trait loci; QTL) kao i precizno kartiranje gena koje se koriste u oplemenjivanju bilja za identifikaciju biljnih genetskih izvora kao i odabir pomo\u0107u biljega (marker-assisted selection; MAS). Iako je genotipizacija upotrebom \u010dipova postala referentna metoda, novija metoda genotipizacije sekvenciranjem (genotyping by sequencing; GBS) omogu\u0107uje jo\u0161 ve\u0107u propusnost, a sekvenciranje kratkih sljedova osigurava genotipizaciju sa smanjenim tro\u0161kovima i znatno ve\u0107om koli\u010dinom genotipskih informacija. Posljednjih se godina pojavilo vi\u0161e platformi za genotipizaciju poljoprivrednih biljnih vrsta koje su razvijene u EU i SAD na osnovi tehnologije upotrebom \u010dipova ili genotipizacije sekvenciranjem nude\u0107i pouzdana rje\u0161enja za genotipizaciju visoke propusnosti za analizu bioraznolikosti i za molekularno oplemenjivanje bilja.<\/p>\n

Glavni su ciljevi sljede\u0107i:<\/p>\n

1. Optimizirati protokole genotipizacije uvo\u0111enjem zajedni\u010dkih standardnih laboratorijskih i analiti\u010dkih postupaka<\/p>\n

2. Povezati se s najva\u017enijim laboratorijima za genotipizaciju u EU koji osmi\u0161ljavaju i razvijaju najnaprednije platforme za genotipizaciju<\/p>\n

3. Procijeniti, usporediti i izabrati nove platforme za genotipizaciju koje \u0107e u kona\u010dnici biti rutinski kori\u0161tene na svim biljnim vrstama ovisno o ciljevima istra\u017eivanja.\n<\/p>\n

 <\/p>\n<\/div>

<\/div><\/div><\/div><\/div><\/div><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"parent":0,"menu_order":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":{"footnotes":""},"class_list":["post-244","page","type-page","status-publish","hentry"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/biodiv.iptpo.hr\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/pages\/244","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/biodiv.iptpo.hr\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/biodiv.iptpo.hr\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/biodiv.iptpo.hr\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/biodiv.iptpo.hr\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=244"}],"version-history":[{"count":8,"href":"https:\/\/biodiv.iptpo.hr\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/pages\/244\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":611,"href":"https:\/\/biodiv.iptpo.hr\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/pages\/244\/revisions\/611"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/biodiv.iptpo.hr\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=244"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}